Kort antwoord: e-Boekhouden, Exact Online, Moneybird, Snelstart en Jortt koppelen met Shopify, WooCommerce, Lightspeed en Mollie, meestal via een externe partij; AFAS SB noemt in zijn eigen koppelingenoverzicht Shopify, WooCommerce en Mollie, maar geen Lightspeed; Rompslomp noemt in zijn eigen overzicht onder meer Shopify, WooCommerce, Lightspeed, Bol.com, CCV Shop en Mijnwebwinkel, maar geen Mollie. Het verschil zit in limieten, voorraad en prijs. Het goedkoopste pakket zonder limiet op boekingen dat ook factureert, is Snelstart inKaart (€22 per maand, 1 gebruiker, met basis voorraadbeheer); uitgebreid voorraadbeheer zit in inZicht (€54). Werk je met meer mensen in de administratie, dan is e-Boekhouden Standaard + Factureren (€24 per maand, gratis extra gebruikers, voorraadmodule) goedkoper. Voer je meerdere webshops of bedrijven in aparte administraties, dan heeft AFAS SB 5 administraties en 2 gebruikers in één prijs van €59,99 per maand (btw-vermelding niet op de prijspagina). Werk je met inkooporders en voorraadlijsten, dan kies je tussen Snelstart inControle of inHandel (op aanvraag) en Exact Handel (vanaf €269 per maand). Alle bedragen exclusief btw tenzij anders vermeld, gecontroleerd op 2 november 2026 (AFAS SB op 5 november 2026).
Koppelingen, OSS en voorraad per pakket staan in de vergelijkingstabel, de bedragen per jaar in wat kost het per jaar. Met de rekenhulp boekhoudsoftware zie je per pakket het goedkoopste passende plan voor jouw aantal facturen.
Hieronder per pakket welke webshop- en betaalkoppelingen de leverancier zelf noemt, hoe het met OSS en voorraad zit, en wat het per jaar kost. Een volledig overzicht van alle boekhoudpakketten staat in beste boekhoudprogramma 2026. Hoe de boekhouding past in het vaste werk rond je webshop, met de kosten per maand, lees je bij de taken en kosten van webshopbeheer.
Waar let je op als webshop?
- Koppeling met je webshopplatform. Bij Shopify, WooCommerce en Lightspeed bouwen bij deze zeven pakketten meestal externe partijen de koppeling (zoals Combidesk, Webwinkelfacturen.nl of S for Software). Wat er precies wordt overgezet (orders, betalingen, retouren, voorraad), verschilt per koppeling.
- Koppeling met je betaalprovider. Mollie of MultiSafepay betalen gebundeld uit; een koppeling matcht die uitbetaling met de losse bestellingen.
- Btw over de grens. In Nederland is het algemene btw-tarief 21% en het verlaagde tarief 9%. Verkoop je goederen aan particulieren in andere EU-landen voor meer dan €10.000 per kalenderjaar, dan reken je de btw van het land van de klant en kun je die in één keer aangeven via de Unieregeling (OSS) (Belastingdienst).
- Voorraad. Niet elk pakket heeft voorraadbeheer; bij sommige zit het pas in een duurder pakket.
- Limieten. Een webshop maakt veel facturen en banktransacties. Let op limieten zoals 25 verkoopfacturen per maand (Exact Essentials), 50 verwerkte banktransacties (Moneybird Groei), 240 boekingen per boekjaar (e-Boekhouden ZZP Pakket) of 250 boekingen per maand (Jortt ZZP).
De zeven pakketten
e-Boekhouden.nl
- Koppelingen: e-Boekhouden noemt webshopkoppelingen met onder meer Shopify, WooCommerce, Lightspeed, Magento, CCVshop, Mijnwebwinkel, PrestaShop, JouwWeb en bol.com. Staat je webshop er niet bij, dan kun je de API gebruiken.
- Betaalproviders: onder meer Mollie, MultiSafepay, PayPal, Pay.nl, Adyen en Buckaroo. Volgens e-Boekhouden worden openstaande facturen dan automatisch gematcht met de binnengekomen bedragen.
- OSS: “Voor OSS-regelingen behoud je zelf de controle met een duidelijke, handmatige verwerking.”
- Voorraad: een voorraadmodule die de voorraadwaarde automatisch berekent en productvariaties, prijzen en artikelnummers (SKU’s) op één plek beheert. Inkooporders noemt e-Boekhouden daar niet.
- Prijs: ZZP Pakket €9,95 (maximaal 240 boekingen per boekjaar), Standaard €14,50 (onbeperkt boekhouden, zonder factureren) en Standaard + Factureren €24 per maand. Gratis extra gebruikers. Welkomstvoordeel: 12 maanden 50% korting, of voor starters 15 maanden gratis vanaf de KVK-inschrijving. 14 dagen gratis proberen.
AFAS SB
- Koppelingen: Shopify en WooCommerce staan in het eigen koppelingenoverzicht: bestellingen met de status “afgerond” komen elk uur automatisch als verkoopjournaalpost in AFAS SB en nieuwe kopers worden als klant aangemaakt; je kunt de journaalposten ook handmatig ophalen. Daarnaast noemt AFAS SB een koppeling met Webwinkelfacturen.nl voor bestellingen uit je webshop. Een Lightspeed-koppeling staat niet op de koppelingenpagina.
- Betaalproviders: Mollie staat in het koppelingenoverzicht; MultiSafepay staat niet op de koppelingenpagina.
- OSS: niet vermeld.
- Voorraad: je legt artikelen en diensten vast met prijs en productgroep per administratie; een voorraadfunctie noemt AFAS SB niet.
- Prijs: €59,99 per maand voor alle functies en onbeperkt boekhouden, met 2 gebruikers en 5 administraties; een extra gebruiker kost €5 per maand, een administratie boven de vijf €15 per maand (maximaal 10). De prijspagina vermeldt niet of de bedragen in- of exclusief btw zijn. Maandelijks opzegbaar, 30 dagen gratis proberen (afas-sb.nl, 5 november 2026).
- Let op: voorraad en OSS houd je buiten AFAS SB bij, bijvoorbeeld in je webshop.
Probeer AFAS SB 30 dagen gratis →
Rompslomp
- Koppelingen: het koppelingenoverzicht van Rompslomp noemt als webshops Bol.com, CCV Shop, Ecwid, JouwWeb, Lightspeed, Magento, Mijnwebwinkel, OpenCart, PrestaShop, Shopify en WooCommerce; bestellingen en facturen gaan automatisch naar de boekhouding. Het aantal koppelingen per account hangt af van je pakket: 1 bij Puur Factuur en Basic, 2 bij Professional en 6 bij Master.
- Betaalproviders: facturen hebben een iDEAL | Wero-betaallink; Mollie en MultiSafepay staan niet in het koppelingenoverzicht.
- Btw over de grens: voor een bestelling uit een ander EU-land pas je volgens Rompslomp het btw-tarief aan; een OSS-aangifte noemt Rompslomp niet. Retouren boek je als aparte, negatieve boekingen.
- Voorraad: voorraadadministratie en productbeheer vanaf Professional.
- Prijs: Puur Factuur €8,95 (8 facturen per maand), Basic €14,95 (10 facturen), Professional €28,95 en Master €42,95 per maand (onbeperkt facturen), exclusief btw. Professional probeer je 30 dagen gratis (rompslomp.nl/tarieven, /webshops en /koppelingen/overzicht, 5 november 2026).
- Let op: met Puur Factuur en Basic zit je bij een webshop snel aan de factuurgrens; voor een webshop met voorraad reken je met Professional.
Probeer Rompslomp Professional 30 dagen gratis →
Exact Online
- Koppelingen: de Exact Online App Store toont voor Shopify apps van xCore, iWebDevelopment en Combidesk, voor WooCommerce vijf apps (o.a. Combidesk, CommerceBird, xCore) en voor Lightspeed eCom apps van Combidesk, xCore en iWebDevelopment. De Shopify-app van Combidesk synchroniseert volgens de omschrijving “Shopify-orders, Shopify Payments en OSS-btw”.
- Betaalproviders: Mollie via de Mollie Aflettermodule van Combidesk of ZioSync. Voor MultiSafepay gaf de App Store op 2 november 2026 geen resultaat.
- Voorraad: niet in de Boekhouden-pakketten. Exact Handel heeft voorraadbeheer vanaf Essentials (€269 per maand), meerdere magazijnen vanaf Plus (€449) en variabele opslaglocaties vanaf Professional (€599).
- Prijs Boekhouden: Essentials €49 (1 gebruiker, 25 verkoopfacturen per maand), Plus €99 (100 verkoopfacturen per maand), Professional €159 en Premium €299 (onbeperkt verkoopfacturen) per maand. Per extra verstuurde factuur rekent Exact €0,50. 30 dagen gratis proberen.
- Let op: met veel orders is Essentials door de factuurlimiet niet genoeg; vraag na of facturen uit je webshopkoppeling meetellen. Lees ook de Exact Online review 2026.
Moneybird
- Koppelingen: Shopify (Combidesk, Webwinkelfacturen.nl), WooCommerce (Combidesk, ExtensionTree, Tussendoor, Webwinkelfacturen.nl), Lightspeed (Combidesk, Webwinkelfacturen.nl), plus onder meer CCV Shop, Magento 2, Mijnwebwinkel en bol.com. Moneybird bouwt deze koppelingen niet zelf. Zie ook de Shopify-koppeling en OSS in Moneybird.
- Wat de Shopify-koppeling doet (volgens Moneybird): elke 60 minuten worden bestellingen facturen, met klantgegevens, btw, kortingen en verzendkosten; een retour wordt automatisch een creditfactuur; de koppeling is OSS-compatibel.
- Betaalproviders: Mollie (Combidesk, pspbetalingen.nl, TransactieSysteem) en MultiSafepay (pspbetalingen.nl).
- OSS: het btw-rapport toont de bedragen per EU-land; de aangifte Unieregeling zelf kan niet via Moneybird.
- Voorraad: niet op de prijspagina; Moneybird heeft een categorie koppelingen met voorraadsoftware.
- Prijs: Compact €4, Start €18, Groei €35 en Compleet €49 per maand bij maandbetaling (€3, €15, €29 en €41 bij jaarbetaling, minimaal 16% korting). Compact verwerkt 5 banktransacties en 1 verkoopfactuur, Start 20 transacties zonder externe bankkoppeling, Groei 50 transacties met 5 bankkoppelingen en 5 gebruikers, Compleet onbeperkt. 60 dagen gratis proberen op Compleet.
Snelstart
- Koppelingen: de eigen webshopkoppeling zit alleen in inHandel; volgens Snelstart koppel je daarmee onder meer bol, Amazon, WooCommerce en Shopify. In de andere pakketten koppel je via partners op snelstart.nl/koppelingen, zoals de Connect Snelstart-Shopify-koppeling, WooCommerce, Shopify en Lightspeed eCom via Webwinkelfacturen.nl, en Lightspeed, Magento en Mijnwebwinkel via S for Software.
- Betaalproviders: Mollie, MultiSafepay en Adyen via S for Software; Mollie, Pay.nl, Tikkie, MultiSafepay en CCV Online Payments via PSP-betalingen van Webwinkelfacturen.nl.
- OSS: bij inHandel draag je volgens Snelstart “automatisch de juiste btw af per land”. Voor de andere pakketten noemt Snelstart geen OSS-functie.
- Voorraad: basis voorraadbeheer vanaf inKaart; financieel en uitgebreid voorraadbeheer en samengestelde artikelen vanaf inZicht; inkooporders, backorders en voorraadlijsten in inControle en inHandel; orderpicking en pick- en bulklocaties alleen in inHandel.
- Prijs: inKaart €22, inBalans €39,50 en inZicht €54 per maand (1 gebruiker); inControle en inHandel op aanvraag. Dit is een selectie: Snelstart heeft zeven pakketten, zie Snelstart prijzen 2026. 30 dagen gratis proberen.
Probeer Snelstart 30 dagen gratis
Jortt
- Koppelingen: het App-center noemt onder E-commerce onder meer WooCommerce, Shopify, CCV Shop, Lightspeed, Ecwid, Magento, PrestaShop, Mijnwebwinkel en bol, plus de eigen jortt.shop. Andere software koppel je via de open API of via Zapier of Make.
- Betaalproviders: Mollie staat in het App-center bij de bankkoppelingen; MultiSafepay staat er niet in (2 november 2026). Jortt Plus bevat het eerste jaar een gratis Mollie zakelijke rekening, daarna €9 per maand.
- Voorraad: niet op de prijspagina.
- Prijs: Starter gratis (facturen, offertes, uren, geen boekhouding), ZZP €21,95 (eenmanszaak tot 250 boekingen per maand), MKB €29,95 (onbeperkt boekingen) en Plus €39,95 per maand bij maandbetaling (€19,95, €27,95 en €37,95 bij jaarbetaling). Plus noemt Jortt “Ideaal voor webshop, bol en SAAS”, inclusief “webshop factuur- en betaalverwerking”. 30 dagen gratis proberen; wie binnen die 30 dagen een abonnement neemt, betaalt de eerste 3 maanden €9,95 per maand.
Vergelijkingstabel: koppelingen, OSS en voorraad
| e-Boekhouden | AFAS SB | Rompslomp | Exact Online | Moneybird | Snelstart | Jortt | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Shopify | Ja | Ja | Ja | Via partners (App Store) | Via partners | Via partners; eigen koppeling in inHandel | Ja (App-center) |
| WooCommerce | Ja | Ja | Ja | Via partners (App Store) | Via partners | Via partners; eigen koppeling in inHandel | Ja (App-center) |
| Lightspeed | Ja | Niet genoemd | Ja | Lightspeed eCom via partners | Via partners | Via partners | Ja (App-center) |
| Mollie | Ja | Ja | Niet genoemd | Via partners | Via partners | Via partners | Ja (bij bankkoppelingen) |
| MultiSafepay | Ja | Niet genoemd | Niet genoemd | Niet gevonden in App Store | Via partner | Via partners | Niet in App-center |
| OSS | Handmatige verwerking | Niet vermeld | Btw-tarief per EU-land aanpassen; OSS-aangifte niet vermeld | Shopify-app van Combidesk synchroniseert OSS-btw | Bedragen per EU-land; aangifte niet via Moneybird | Automatisch in inHandel | Niet vermeld |
| Voorraadbeheer | Voorraadmodule | Geen voorraadfunctie genoemd | Vanaf Professional (€28,95) | Handel vanaf €269 | Via koppeling | Basis vanaf inKaart, uitgebreid vanaf inZicht | Niet vermeld |
| Retour automatisch als creditfactuur | Niet vermeld | Niet vermeld | Niet vermeld; retouren boek je als negatieve boeking | Niet vermeld | Ja, bij Shopify-koppeling | Niet vermeld | Niet vermeld |
Bron: koppelingen- en prijspagina’s van de leveranciers en de Exact Online App Store, 2 november 2026 (AFAS SB: afas-sb.nl/koppelingen en /boekhoudprogramma/webshops; Rompslomp: rompslomp.nl/koppelingen/overzicht, /webshops en /tarieven; beide 5 november 2026; “Niet genoemd” = staat niet op de koppelingenpagina). “Ja” betekent dat de leverancier de koppeling in zijn eigen overzicht noemt; wie hem bouwt, staat daar niet altijd bij.
Wat kost het per jaar?
Dezelfde maatstaf voor alle zeven: het goedkoopste pakket zonder limiet op boekingen, transacties of verkoopfacturen dat ook kan factureren, met één gebruiker, exclusief btw en zonder welkomstkorting. (e-Boekhouden Standaard, €14,50 per maand, is onbeperkt maar zonder factureren.)
| Pakket | Per maand | Per jaar | Extra voor een webshop |
|---|---|---|---|
| Snelstart inKaart | €22 | €264 | Basis voorraadbeheer; uitgebreid in inZicht (€54, €648 per jaar) |
| e-Boekhouden Standaard + Factureren | €24 | €288 | Voorraadmodule, gratis extra gebruikers |
| Rompslomp Professional | €28,95 | €347,40 | Voorraadadministratie en productbeheer; 2 extra gebruikers |
| Jortt MKB | €29,95 / €27,95 bij jaarbetaling | €359,40 / €335,40 | Plus (€39,95, €479,40 per jaar) met webshop factuur- en betaalverwerking |
| Moneybird Compleet | €49 / €41 bij jaarbetaling | €588 / €492 | Onbeperkt gebruikers en bankkoppelingen |
| AFAS SB | €59,99 | €719,88 | Eén pakket met 2 gebruikers en 5 administraties; geen voorraadfunctie genoemd; btw-vermelding niet op de prijspagina |
| Exact Online Professional | €159 | €1.908 | Voorraad pas in Exact Handel (vanaf €269 per maand, €3.228 per jaar) |
Snelstart inKaart (€264) is het goedkoopste pakket zonder limiet, maar met één gebruiker: met een tweede gebruiker (€4,25 per maand) kost het €315 per jaar, meer dan e-Boekhouden met gratis extra gebruikers (€288). Bij een kleine webshop met weinig orders kan een goedkoper pakket met limiet volstaan, zoals e-Boekhouden ZZP Pakket (€9,95, €119,40 per jaar, tot 240 boekingen per boekjaar). Koppelingen van externe partijen (zoals Combidesk of Webwinkelfacturen.nl) hebben hun eigen voorwaarden; kijk bij die partij wat ze kosten.
Welk pakket past bij welk webshopplatform?
- Shopify: alle zeven hebben een koppeling. Wil je vooraf weten dat retouren automatisch als creditfactuur binnenkomen, dan is Moneybird (Shopify-koppeling van Combidesk) het enige pakket dat dat op zijn eigen site beschrijft.
- WooCommerce: alle zeven hebben een koppeling; bij Moneybird kun je kiezen uit vier bouwers (Combidesk, ExtensionTree, Tussendoor, Webwinkelfacturen.nl), bij Exact uit vijf apps.
- Lightspeed: alle pakketten behalve AFAS SB noemen een Lightspeed-koppeling, Rompslomp in zijn eigen overzicht; Exact en Snelstart via partners voor Lightspeed eCom.
Zo kies je
- Kies e-Boekhouden als je geen inkooporders nodig hebt, met meer dan één persoon in de administratie werkt en een vaste prijs zonder limiet zoekt (Standaard + Factureren €24, gratis extra gebruikers); met weinig boekingen is het ZZP Pakket (€9,95, tot 240 boekingen per boekjaar) genoeg.
- Kies AFAS SB als je op Shopify of WooCommerce verkoopt en meerdere webshops of bedrijven in aparte administraties wilt voeren voor één prijs: €59,99 per maand met 5 administraties en 2 gebruikers. Voorraad en OSS regel je dan buiten AFAS SB.
- Kies Rompslomp als je verkoopt op een platform uit zijn koppelingenoverzicht (ook Bol.com, CCV Shop en Mijnwebwinkel) en voorraad in de boekhouding wilt: Professional (€28,95 per maand exclusief btw) heeft onbeperkt facturen en voorraadadministratie. Betaal je via Mollie, dan staat die koppeling er niet bij.
- Kies Moneybird als je op Shopify verkoopt en orders, retouren en OSS-bedragen via de Combidesk-koppeling wilt laten binnenkomen, en je voorraad buiten je boekhouding bijhoudt. Groei (€35) heeft 50 verwerkte transacties; met meer kies je Compleet.
- Kies Snelstart als je alleen werkt en de laagste prijs zonder limiet zoekt, of voorraad in je boekhouding wilt: inKaart (€22) voor basis voorraadbeheer, inZicht (€54) voor uitgebreid voorraadbeheer en orderbeheer, of een offerte voor inControle/inHandel als je met inkooporders, orderpicking of automatische OSS-afdracht wilt werken.
- Kies Jortt als je automatisch wilt laten boeken en een eenmanszaak met tot 250 boekingen per maand hebt (ZZP €21,95), of Plus (€39,95) wilt met webshop factuur- en betaalverwerking. Jortt Starter is gratis maar bevat geen boekhouding.
- Kies Exact Online als je voorraad met meerdere magazijnen, serie- en batchnummers (Exact Handel Plus, €449 per maand) of materiaalplanning (Professional, €599) nodig hebt of al een boekhouder hebt die met Exact werkt. Voor gewone boekhouding met veel orders reken je met Professional (€159), omdat Essentials 25 en Plus 100 verkoopfacturen per maand bevatten.
Op basis van je eigen situatie een aanbeveling? Gebruik de keuzehulp boekhoudsoftware.
Probeer Moneybird 60 dagen gratis →
Bekijk ook het overzicht van alle boekhoudsoftware. Andere tools voor je webshop staan in ons artikel over de beste software voor webshops.
Prijzen en koppelingen gecontroleerd op 2 november 2026 op de websites van de aanbieders. Bedragen exclusief btw.
Externe bron: Belastingdienst — BTW info — onafhankelijke informatie over dit onderwerp.