03-03-2026 · 5 min leestijd · Bijgewerkt 03-03-2026

Boekhoudsoftware voor stichtingen (2026): vergelijk en kies

Start keuzehulp Bereken kosten Alle boekhoudsoftware

Stichtingen en non-profitorganisaties hebben een andere boekhoudkundige werkelijkheid dan commerciele bedrijven. Je werkt met subsidies die verantwoord moeten worden, donaties die vallen onder ANBI-wetgeving, vrijwilligers die soms wel en soms niet vergoed worden, en een bestuur dat wettelijk verantwoordelijk is voor de financiele verslaglegging. Standaard boekhoudsoftware is vaak niet ingericht op deze eisen. Ik bespreek welke tools het beste werken voor Nederlandse stichtingen.

Wat heeft een stichting nodig van boekhoudsoftware?

Stichtingen stellen specifieke eisen die commerciele software niet altijd dekt:

  • Fondsadministratie – Subsidies, donaties en eigen inkomsten apart bijhouden en verantwoorden
  • ANBI-vereisten – Als ANBI-stichting moet je financiele gegevens openbaar publiceren; je software moet de juiste overzichten kunnen genereren
  • Projectboekhouding – Kosten en inkomsten per project of subsidietraject bijhouden voor verantwoording aan subsidiegevers
  • Bestuurrapportages – Het bestuur wil periodiek inzicht in de financiele positie, zonder dat ze boekhoudkundig onderlegd hoeven te zijn
  • Jaarrekening – Wettelijk verplicht; je accountant moet de jaarrekening kunnen samenstellen vanuit het systeem
  • BTW-positie – Stichtingen zijn vaak deels BTW-plichtig en deels vrijgesteld; dit vereist een correcte BTW-administratie
  • Vrijwilligersvergoedingen – Kleine vergoedingen binnen de vrijwilligersregeling correct registreren

Beste boekhoudsoftware voor stichtingen

1. Exact Online – Meest gebruikte systeem voor non-profit in Nederland

Exact Online is het meest gebruikte boekhoudpakket voor Nederlandse stichtingen en dat heeft een praktische reden: het wordt door bijna elke accountant in Nederland ondersteund. Voor een stichting met een externe accountant die de jaarrekening samenstelt, is dat een groot voordeel – je hoeft je data niet te exporteren of te converteren. Exact Online ondersteunt fondsadministratie via projecten en kostenplaatsen.

Wat werkt goed voor stichtingen:

  • Projectboekhouding per subsidietraject of fonds
  • Kostenplaatsen voor verantwoording per activiteit of afdeling
  • Uitgebreide rapportages voor bestuur en subsidiegevers
  • Directe koppeling met de meeste accountantsorganisaties in Nederland
  • BTW-administratie voor gedeeltelijk BTW-plichtige stichtingen
  • Cloudgebaseerd: meerdere bestuursleden en medewerkers tegelijk toegang

Wat ontbreekt: Geen specifieke ANBI-module out-of-the-box; fondsadministratie vereist maatwerk in de configuratie.

Prijs: Exact Online Accounting: EUR 44 per maand. Meerdere gebruikers en extra modules kosten extra.

Bekijk Exact Online


2. Twinfield – Beste voor stichtingen met complexe verantwoording

Twinfield (Wolters Kluwer) is de keuze voor stichtingen met een complexe financiele structuur: meerdere subsidiestromen, internationale activiteiten of een grote projectportfolio. De dimensionele opzet van Twinfield maakt het mogelijk om kosten en opbrengsten te splitsen naar fonds, project, activiteit en periode in een en hetzelfde systeem – zonder dat je aparte spreadsheets hoeft bij te houden.

Wat werkt goed voor stichtingen:

  • Meerdere dimensies: kostenplaats, project, fonds en activiteit combineerbaar
  • Geavanceerde rapportage-editor voor maatwerk bestuurrapportages
  • Intercompany-verwerking voor stichtingen met nevenorganisaties
  • Audit trail en compliance-functies voor verantwoording aan subsidiegevers
  • Breed geaccepteerd door accountants en registeraccountants
  • Multi-currency voor stichtingen met internationale donateurs of subsidienten

Wat ontbreekt: Hogere leercurve; configuratie vereist boekhoudkundige expertise of implementatiepartner.

Prijs: Vanaf EUR 55 per maand; prijs afhankelijk van gebruikers en transactievolume.

Bekijk Twinfield


3. AFAS Software – Beste voor grotere stichtingen met meerdere afdelingen

AFAS is in de zorg- en welzijnssector een veelgebruikt systeem en richt zich specifiek op het non-profitsegment. Voor stichtingen met meer dan vijftien medewerkers, een eigen HR-afdeling en complexe salarisadministratie biedt AFAS een geintegreerde oplossing die Exact Online en Twinfield niet kunnen evenaren. AFAS non-profit bevat specifieke modules voor subsidiemanagement en ANBI-verantwoording.

Wat werkt goed voor stichtingen:

  • Non-profitspecifieke modules: subsidiemanagement en verantwoording
  • Geintegreerde salarisadministratie voor medewerkers en vrijwilligersregistratie
  • HRM-module voor personeelsdossiers, functioneringsgesprekken en verlof
  • Portaal voor medewerkers en bestuursleden
  • Sterke rapportagetool voor bestuur en subsidiegevers
  • Koppeling met bankieren, donaties en ANBI-registratie

Wat ontbreekt: Hogere implementatiekosten en langere doorlooptijd; niet geschikt voor kleine stichtingen.

Prijs: Op aanvraag (typisch EUR 80 tot EUR 160 per gebruiker per maand afhankelijk van modules).

Bekijk AFAS Software


Vergelijking: boekhoudsoftware voor stichtingen

SoftwarePrijs per maandFondsadministratieANBI-ondersteuningSalarisadministratieAccountantsintegratie
Exact OnlineEUR 44+Via projectenBeperktVia moduleUitstekend
TwinfieldEUR 55+Via dimensiesBeperktNee (extern)Uitstekend
AFASOp aanvraagJa (non-profit)JaIngebouwdGoed

Mijn advies

  • Kleine tot middelgrote stichting met externe accountant: Exact Online – breed ondersteund, overzichtelijk en voldoende functioneel voor de meeste non-profitorganisaties.
  • Stichting met complexe subsidiestructuur of internationale activiteiten: Twinfield – de dimensionele boekhouding geeft het meeste inzicht in fondsen en projecten.
  • Grote stichting met eigen HR en meerdere afdelingen: AFAS non-profit – de geintegreerde suite is hier het meest efficient.

Weet je nog niet welk systeem het beste past bij jouw stichting? Gebruik de boekhouding keuzehulp voor een advies op maat. Bereken ook de totale softwarekosten voor jouw organisatie inclusief implementatie en ondersteuning.

Hoe wij vergelijken

Onze vergelijking is gebaseerd op vier criteria: functionaliteit (features die specifiek voor deze branche relevant zijn), prijs-kwaliteitsverhouding (totale eigendomskosten inclusief implementatie en support), gebruiksgemak (leercurve en kwaliteit van de ondersteuning) en integratiekracht (koppelingen met boekhouding, HR en andere systemen). We nemen alleen systemen op die actief onderhouden worden en beschikbaar zijn in Nederland.

Prijzen en functies kunnen wijzigen. Wij controleren deze pagina elk kwartaal op actualiteit. Raadpleeg de website van de aanbieder voor de actuele tarieven.

Handige vervolgstappen

Stichtingen in de zorgsector hebben naast boekhouding ook te maken met complexe HR-vraagstukken zoals CAO Zorg en BIG-registraties. Op de pagina HR software voor zorg vind je een vergelijking van systemen die hierop zijn ingericht.

Donateurs en subsidiegevers bijhouden vraagt om een gestructureerd relatiebeheersysteem naast de financiƫle administratie. Op de pagina CRM voor consultants staan toegankelijke CRM-opties die ook voor non-profitorganisaties geschikt zijn.

Een stichting die haar doelgroep wil bereiken heeft baat bij een basale marketingtool voor nieuwsbrieven en campagnes. Op de pagina marketing software voor MKB vergelijken we welke tools ook voor non-profit goed werken.

Start keuzehulp Bereken kosten Alle boekhoudsoftware

Lees ook

LV
Lars de Vries
Onafhankelijk software consultant met 6 jaar ervaring in SaaS. Helpt MKB-bedrijven bij het kiezen van de juiste tools.